MolekuláRNĚ genetická diagnostika deficitu c4 složky komplementu




Download 0,61 Mb.
bet2/3
Sana31.12.2019
Hajmi0,61 Mb.
#7090
1   2   3

Geny C4A i C4B obsahují shodně 41 exonů lišící se v několika nukleotidech a kódující transkript pro prekurzorový protein C4 o 1744 aminokyselinových zbytcích (Yu, 1991). Tento jednořetězcový prekurzor (Mr 200 000) je následnými posttranslačními úpravami přeměněn na trojřetězcovou molekulu C4 účastnící se vlastní komplementové kaskády (Hall and Colten, 1977).

Tři řetězce (alfa, beta a gama) proteinu C4 jsou na molekule DNA prekurzoru C4 uspořádané v pořadí beta-alfa-gama. Místa štěpení mezi těmito řetězci jsou kódovány sekvencemi nacházejcími se v exonu 16 (pro řetězce beta-alfa) a v exonu 33 (pro řetězce alfa-gama) (Yu,1991).


Řetězec beta je tvořený 656 aminokyselinovými zbytky a je kódovaný exony 1 až 16. Obsahuje nejrozsáhlejší intron genu C4 (intron 9) dlouhý 6 – 7 kb (Yu, 1991) vyskytující se ve většině prvních lokusů (většinou kódujících C4A), ale pouze v některých druhých lokusech (většinou kódujících C4B) (Yu and Campbell, 1987).

Řetězec alfa sestává ze 770 aminokyselin a je kódovaný exony 16 až 33. Obsahuje sekvence kódující dvě významné složky komplementové kaskády. První složkou je anafylatoxin C4a. Ten je kódovaný částí exonu 16 (11 aminokyselin) a celým exonem 17 (66 aminokyselin). Místem štěpení je arginin na pozici 737, na který se váže jednotka C1s komplementové kaskády zajišťující aktivaci proteinu C4 (rozštěpením proteinu na složky C4a a C4b). Druhou významnou složkou komplementové kaskády je fragment C4d, který je kódovaný exony 23 až 30. Za vyštěpení tohoto fragmentu v procesu deaktivace složky C4b je odpovědný faktor I. Na fragmentu C4d se nachází velmi důležité antigenní determinanty Rodgers a Chido, dále pak isotypové, polymorfní a thioesterové aminokyselinové zbytky determinující isotypy C4A a C4B (Yu, 1991).

Řetězec gama je tvořený 291 aminokyselinami a kódovaný 9 exony (exony 33 až 41). Obsahuje druhý největší intron (dlouhý 1494 bp). Oproti řetězcům alfa a beta je konzervativnější. Zatím u něj nebyla popsána žádná specifická funkce (Yu, 1991).

2. 1. 1. Polymorfismus genů C4A a C4B

Jak bylo uvedeno, C4A a C4B jsou lokusy genu C4 kódující dvě isotypové formy proteinu C4, který se účastní komplementové kaskády. Díky nukleotidovým (tím i aminokyselinovým) substitucím nebo delecím se oba isotypy vyskytují celkem v 41 variantě. U bělošské populace je nejrozšířenější alelou genu C4A alela C4A3 (85 %) a nejrozšířenější alelou genu C4B je alela C4B1 (86 %) (Blanchong et al., 2000; Yang et al., 2003).

Jednotlivé nukleotidové substituce se projevují rozdílnou elektroforetickou mobilitou, hemolytickou aktivitou, chemickou reaktivitou a antigenními determinantami příslušných variant genu C4 (Tab. 2) (Law et al., 1984).
Tab. 2. Srovnání lidských proteinů C4A a C4B (Yu et al., 1988).





C4A

C4B

1. Elektroforetická mobilita

(a) agarózový gel

(b) SDS-PAGE (řetězec α)

2. Thioesterová reaktivita

(a) hemolytická aktivita

(b) afinita kovalentní vazby

(i) amino-skupina

(ii) hydroxylová skupina

3. Antigenní determinanty*

(antigen krevní skupiny)


rychlá


Mr 96 000
nižší
vyšší

nižší


Rodgers

(Rg: 1, 2)


pomalá


Mr 94 000
vyšší
nižší

vyšší


Chido

(Ch: 1, 2, 3, 4, 5, 6)



* s výjimkou C4A1 a C4B5







Protein C4A je oproti proteinu C4B elektroforeticky pohyblivější. Liší se i molekulovou hmotností řetězců alfa. Pomocí elektroforézy v polyakrylamidovém gelu (SDS-PAGE) byla naměřena molekulová hmotnost (Mr) řetězce alfa proteinu C4A 96 000, u proteinu C4B byla o 2 000 menší (Roos et al., 1982).

Vyšší hemolytickou aktivitu vykazuje protein C4A, což bylo potvrzeno v haplotypech obsahujících nulové alely C4A (C4AQ0) a C4B (C4BQ0), kdy v přítomnosti C4AQ0 byla celková hemolytická aktivita 2× – 3× nižší než v přítomnosti C4BQ0 (Law et al., 1984). Později bylo prokázáno, že snížená hemolytická aktivita nemusí být podmíněna pouze nulovými alelami, ale mohou ji způsobit i mnohem jemnější změny, jakými jsou záměny 1 nukleotidu. Na základě přítomnosti defektní C5 konvertázy byla prokázána nízká nebo téměř žádná hemolytická aktivita u obou isotypů daná substitucí jediné aminokyseliny v řetězci beta proteinu C4. V případě genu C4A byla substituce prokázána u alely C4A6, kdy arginin na pozici 458 byl nahrazen tryptofanem (Anderson et al., 1992). U genu C4B byl pokles hemolytické aktivity zapříčiněn substitucí prolinu za leucin na pozici 459 (McLean et al., 1994).

Rozdílná chemická reaktivita isotypů je dána specifickou sekvencí aminokyselin na řetězci alfa (v oblasti C4d) na pozicích 1101-1106. U C4A se vyskytuje sekvence Pro-Cys-Pro-Val-Leu-Asp (PCPVLD) zajišťující vyšší afinitu aktivované molekuly C4 k peptidovým antigenům obsahujícím aminoskupiny. Naproti tomu u isotypu C4B se vyskytuje sekvence Leu-Ser-Pro-Val-Ile-His (LSPVIH), která způsobuje vyšší afinitu k antigenům s hydroxylovými skupinami sacharidů (Law et al., 1984; Yu et al., 1986).



Kromě již zmíněné rozdílné elektroforetické mobility, hemolytické aktivity a odlišné chemické reaktivity, se isotypy C4A a C4B liší i ve čtyřech dalších aminokyselinách v oblasti řetězce kódujícího C4d fragment. Tyto aminokyseliny, spolu se substitucemi na pozicích 1101-1106, vytvářejí 8 různých epitopů pro antigenní determinanty krevních skupin Rodgers (Rg1 a Rg2) a Chido (Ch1 až Ch6) (Obr. 2). U isotypu C4A se kyselina asparagová objevuje na pozici 1054, asparagin (Rg2) na pozici 1157 a valin a leucin na pozicích 1188 a 1191 (Rg1), zatímco u isotypu C4B je na stejných pozicích glycin (1054), serin (1057; Ch6) a alanin a arginin (1188 a 1191; Ch1). Ve většině případů se epitop Rg vyskytuje u molekul C4A a epitop Ch u C4B. Výjimku představují alotyp C4A1, který je spojený s epitopy Ch1, 2, 5, 6 a alotyp C4B5 spojený s epitopy Rg1 a Rg2. U nízkého procenta populace se objevuje varianta epitopů Rg1 a Ch6 v jedné molekule C4 označovaná WH (Yu et al., 1988).


Obr. 2. Strukturní model popisující všechny sérologicky definované antigeny Rg a Ch založené na známých aminokyselinových rozdílech v exonech 25 – 28 genů C4A a C4B (Schneider et al., 1996, upraveno).

Kromě 8 zmiňovaných polymorfních míst se v sekvenci genu C4 nachází dalších 23 polymorfních míst odhalených nukleotidovou nebo proteinovou sekvenací (Tab. 3, Obr. 3). Nejvíc polymorfních míst bylo objeveno v řetězci alfa (24), a to v oblasti kódující fragment C4d (19 včetně 8 již popisovaných), v řetězci beta bylo detekováno 6 polymorfních míst a pouze jediné polymorfní místo v řetězci gama (Yu, 1991; Blanchong et al., 2001).

Tab. 3. Polymorfismus lidských komplementových proteinů C4A a C4B a kódující sekvence (Blanchong et al., 2001).














alotyp




exon

AMK

substituce



nt

sekvence


A3a

A4

A6

A3b

A13

A1-Ch1

B-dlouhý

B-krátký

B1-SC01

B2

B1a

B1b

B12

B3

B5-Rg1

B1-hi

řetězec beta (1 – 656)




2

F63

TTC/TTT

C

C

T










C

C

C

























9

Y328S

TAT/TCT

A

C

A










A

C

C

C

C

C







C







11

V399A

GTC/GCC

T

C

T










T

T

T

T






















12

R458W

CGG/TGG

C

C

T










C

C

C

C
















C




12

P459L

CGG/CTG

G

G

G

G







G

G

G

G
















T

řetězec alfa (661 1427); C4d (938 – 1327)

C4a

17

L707P

CTG/CCG

T

C

C










C

C

C

C






















20

V806

GTC/GTT

C

C

C










C

T

T

C






















21

G863

GGG/GGT

G

G

G










G

G

T

G






















21

A888T

GCC/ACC

G

G

G










G

A

A

G






















24

L1018

CTG/CTT

G

G

G










G

G

T

G



















Ch5/Ch5

25

D1054G

GAC/GGC

A

A

A

A

A

G

G

G

G

A

G

G

G

G

A







26

G1076

GGC/GGA

C

C

C

C

C

A

A

C

C

C

C

C

A

C

C




C4A/C4B

26

P1101L

CCC/CTC

C

C

C

C

C

C

T

T

T

T

T

T

T

T

T




C4A/C4B

26

C1102S

TGT/TCT

G

G

G

G

G

G

C

C

C

C

C

C

C

C

C




C4A/C4B

26

L1105I

TTA/ATA

T

T

T

T

T

T

A

A

A

A

A

A

A

A

A




C4A/C4B

26

D1106H

GAC/CAT

G-C

G-C

G-C

G-C

G-C

G-C

C-T

C-T

C-T

C-T

C-T

C-T

C-T

C-T

C-T




Ch6/Ch6

28

N1157S

AAC/AGC

A

A

A

A

A

G

G

G

G

G

A

G

G

G

G







28

T1182S

ACA/ATA

C

T

C

C

C

C

C

C

C

C

C

C

C

C

C




Rg1/Ch1

28

A1186

GCG/GCC

G

G

G

G

C

C

C

C

C

C

C

C

C

C

G




Rg1/Ch1

28

V1188A

GTG/GCG

T

T

T

T

C

C

C

C

C

C

C

C

C

C

T




Rg1/Ch1

28

L1191R

CTC/CGG

TC

TC

TC

TC

GG

GG

GG

GG

GG

GG

GG

GG

GG

GG

TC







29

P1226

CCG/CCA

G

G

G

G




G

G

G

G

G

G

G




A

G







29

A1267S

GCG/TCG

G

T

G

T




G

G

G

G

G

G

G




G

G







30

I1298F

ATT/TTT

A

A

A

A







A

A

T

A



















řetězec gama (1432 – 1722)




34

D1478Y

GAC/TAC

G

G

G

G







G

G

G

T



















Polymorfní AMK detekované proteinovou sekvenací nashromážděného séra

















































řetězec β

15

C616S

TGT

















































řetězec α

C4a


17

D708N

GAC

















































řetězec α

C4d


28

S1090I

TCC

















































řetězec α

C4d


29

R1281V

CCG

















































řetězec α

C4d


30

T1286G

ACG

















































řetězec α

C4d


30

V1287G

GTG

















































Obr. 3. Strukturní podstata polymorfismu lidských proteinů C4A a C4B. Na proteinech C4A a C4B bylo odhaleno 24 polymorfních aminokyselinových zbytků. C4A a C4B isotypová rezidua na pozicích 1101-1106 jsou vyznačena červeně a modře. Ostatní aminokyseliny zahrnující Rg a Ch antigenní determinanty jsou značené růžově a zeleně. Většina polymorfních míst se nachází v C-koncové oblasti thioesterového místa v oblasti C4d (Blanchong et al., 2001, upraveno).



Download 0,61 Mb.
1   2   3




Download 0,61 Mb.

Bosh sahifa
Aloqalar

    Bosh sahifa



MolekuláRNĚ genetická diagnostika deficitu c4 složky komplementu

Download 0,61 Mb.