|
Tabiiy Fanlar Fakulteti Biologiya yo’nalishi 22. 59-guruh Talabasi Ortiqov Samandarning Genetika va Genomika asoslari fanidan "Genomikada qo’llaniladigan bioinformatik dasturlar" bo’yicha tayyorlagan referat
|
| bet | 1/3 | | Sana | 14.05.2024 | | Hajmi | 159,08 Kb. | | #233762 | | Turi | Referat |
Bog'liq GENOMIKA BIOINformatik dastur genoogle
Farg’ona Davlat Universiteti
Tabiiy Fanlar Fakulteti
Biologiya yo’nalishi 22.59-guruh
Talabasi Ortiqov Samandarning
Genetika va Genomika asoslari fanidan
“Genomikada qo’llaniladigan bioinformatik dasturlar” bo’yicha tayyorlagan referati
Mavzu: Genoogle dasturi
Genoogle BETA 0.81
Genoogle - tez o'xshash DNK ketma-ketligini qidirish uchun dastur. Bu oddiy skript tili, veb-interfeys va veb-xizmat interfeysi bilan matn rejimi interfeysiga ega bo'lgan to'liq funktsional yoki shunga o'xshash genetik qidiruv vositasi.
Genoogle indekslash va parallel ishlov berish usullaridan foydalanadi va u Java-da ishlab chiqilgan. Genoogle bepul va ochiq manba hisoblanadi. Genoogle nomi Genes + Google-dan kelib chiqqan bo'lib, yakuniy dunyo hukmronligi rejasi - Google-ga o'xshash genlarni aniqlash uchun dasturiy ta'minotni ishlab chiqish va Genoogle Internetdagi ma'lumotlarni joylashtirishdir va Genoogle Google Inc bilan hech qanday aloqasi yo'q va umid qilamanki, uning nomi muammo tug'dirmaydi. .
Genoogle dasturining asosiy xususyatlari:
Tez o'xshash ketma-ketliklarni qidirish.
Haqiqatan ham yaxshi sezuvchanlik.
Matn rejimi interfeyslari.
Veb-xizmatlar interfeysi.
Juda oddiy veb-interfeys, lekin JSP-ni qo'llab-quvvatlaydi.
Yaxshi xotira talablari. (4 gigabaytlik ma'lumotlar banki uchun 4 gigabaytdan ko'p bo'lmagan RAM xotirasi kerak).
Windows va Linuxda ishlash (va sinovdan o'tgan).
8 gigabaytdan ortiq bo'lgan ma'lumotlar banklari.
Konsol va ommaviy interfeyslar.
Genoogle vektorlardan teskari indekslar ma'lumotlar tuzilmalari sifatida foydalanadi. Asosiy vektorning o'lchami mumkin bo'lgan pastki ketma-ketliklarning miqdori: DNK kabi alifbo 4 ta harfdan iborat bo'lib, 4n kichik ketma-ketliklar bo'lishi mumkin, ular belgilangan pastki ketma-ketlik uzunligi n bo'lib, teskari indeksli 4n yozuvga ega. Har bir kichik ketma-ketlik vektorining o'lchami ushbu kichik ketma-ketlikning ma'lumotlardagi miqdoriga qarab o'zgaradi bank. Har bir kichik ketma-ketlik hodisasi shakllanishni saqlash uchun 4 HARFdan iborat ikkita butun sondan foydalanadi: Bir butun son ketma-ketlikning identifikatorini saqlash uchun, ikkinchisi esa ketma-ketlikni saqlash uchun ishlatiladi.
|
|
Bosh sahifa
Aloqalar
Bosh sahifa
Tabiiy Fanlar Fakulteti Biologiya yo’nalishi 22. 59-guruh Talabasi Ortiqov Samandarning Genetika va Genomika asoslari fanidan "Genomikada qo’llaniladigan bioinformatik dasturlar" bo’yicha tayyorlagan referat
|
