27
to‘plamining bir-biriga mos kelishiga misol 2-rasmda keltirilgan.
bir xil kirish
ma’lumotlar to‘plami va maksimal PID bilan ta’minlangan dasturlar hajmi va
mazmunida sezilarli darajada o‘xshashlikka ega.
Protein ketma-ketligi ma’lumotlar bazalaridan ortiqcha narsalarni olib tashlash
uchun keng tarqalgan bo‘lib foydalaniladigan turli xil kompyuter dasturlarini keng
miqyosda taqqoslash amalga oshirildi. Turli xil hisoblash yondashuvlari aniq bir oz
boshqacha natijalar beradi. Agar bu mutlaqo kutilmagan bo‘lmasa, bu
algoritmlarning barchasida bir nechta farqlar kuzatilganligi sababli, bu juda qiziq.
Dasturni afzal ko‘rish ko‘p jihatdan texnik masalalarga bog‘liq bo‘lib,
oddiy va
foydalanuvchilarga qulay bo‘lgan mustaqil bajariladigan dastur mavjudligi, bu
ayniqsa keng ko‘lamli tadqiqotlar uchun jozibador bo‘lib, mahalliy serverni
o‘rnatishda muammolarni bartaraf etadigan veb-server mavjudligiga emas. dasturiy
ta’minotning nusxalari. Ko‘pgina bioinformatikachilar
ortiqcha miqdorni
kamaytirish odatiy va oddiy qadam bo‘lib, mavjud dasturlarning har qandayida
amalga oshirilishi mumkin deb hisoblashadi. Biroq, biz turli dasturlar tomonidan
chiqarilgan ortiqcha bo‘lmagan oqsil ketma-ketliklarining ro‘yxatlari, hatto ketma-
ketliklarning ortiqcha kirish to‘plami bir xil bo‘lsa va ketma-ketlik identifikatorining
foiz chegarasi bir xil bo‘lsa ham, har xil ekanligini hujjatlashtirdik. Taxminan 10 %
gacha bo‘lgan kelishmovchiliklar juda keng tarqalgan.
Bu ushbu kompyuter dasturlari ortiqcha
narsalarni olib tashlashda
qiyinchiliklarga duch kelganligini bildirmaydi. Darhaqiqat, ularning barcha
natijalari chiqishlarda guruhlangan yozuvlar o‘rtasidagi qoldiq o‘xshashlik
nuqtai
nazaridan maqbuldir. Biroq, bu aniq ko‘rsatib turibdiki, bioinformatikada yaxshi
amaliyot oqsillar ketma-ketligi ansambllaridan ortiqcha
narsalarni olib tashlash
uchun bir nechta kompyuter ilovalaridan foydalanish bo‘lishi kerak. Shunday qilib,
barcha hisob-kitoblar ikki yoki undan ortiq ortiqcha bo‘lmagan ketma-ketliklar
to‘plamidan foydalangan holda parallel ravishda amalga oshiriladi va hisob-
kitoblarning yakuniy natijalarini taqqoslash ularning ichki qiymatini kuchaytiradi.
