|
Boshqa ma’lumotlar bazalariBog'liq Biologik ketma –ketliklarni ma’lumot bazalari bo’yicha ko’plikBoshqa ma’lumotlar bazalari
Nukleosoma joylashuvi mintaqasi ma’lumotlar bazasi
Gen ifodasi ma’lumotlar bazalari (asosan mikroarray ma’lumotlari)
Genom ma’lumotlar bazalari
Ushbu ma’lumotlar bazalari genom ketma-ketligini to‘playdi, ularni izohlaydi
va tahlil qiladi va jamoatchilikka kirishni ta’minlaydi. Ba’zilar hisoblangan izohlarni
yaxshilash uchun eksperimental adabiyotlarni qo‘shishadi. Ushbu ma’lumotlar
bazalarida ko‘plab turlar genomlari yoki bitta model organizm genomlari bo‘lishi
mumkin.
ArrayExpress: funktsional genomik ma’lumotlar arxivi; EMBL dan yuqori
samarali funktsional genomik tajribalar ma’lumotlarini saqlaydi
Bioinformatika kombayn
Bachadon bo‘yni saratoni genlari bazasi
Ansambl: inson, sichqoncha, boshqa umurtqali hayvonlar va eukaryot
genomlari uchun avtomatik izohli maʼlumotlar bazalarini taqdim etadi.
Ensembl Genomes: bakteriyalar, protistlar, zamburug‘lar, o‘simliklar va
umurtqasiz hayvonlar metazoalari uchun birlashtirilgan interaktiv va dasturiy
interfeyslar to‘plami (Ensembl dasturiy platformasidan foydalangan holda) orqali
genom miqyosidagi ma’lumotlarni taqdim etadi.
FlyBase: Drosophila melanogaster model organizmining genomi
Gen kasalliklari ma’lumotlar bazasi
Gen ifodasi Omnibus (GEO): massiv va ketma-ketlikka asoslangan
ma’lumotlarni qo‘llab-quvvatlaydigan AQSh Milliy Saraton Institutining (NCI)
ommaviy funktsional genomik ma’lumotlar ombori. Gen ifodasi profillarini so‘rash
va yuklab olish uchun vositalar taqdim etiladi.
Inson oqsili atlasi (HPA): to‘qimalar, hujayralar, hujayra osti bo‘linmalari va
saraton o‘smalaridagi mRNK va oqsil darajasida inson oqsilini kodlovchi genlarning
ekspressiv profillari bilan umumiy ma’lumotlar bazasi.
|
| |
