• Protein modeli ma’lumotlar bazalari ModBase
  • Protein-oqsil va boshqa molekulyar o‘zaro ta’sirlar  BioGRID
  • String
  • 7-rasm. Protein ifodasi ma’lumotlar bazalari
  • Protein tuzilishi ma’lumotlar bazalari




    Download 1,9 Mb.
    Pdf ko'rish
    bet17/20
    Sana07.02.2024
    Hajmi1,9 Mb.
    #152551
    1   ...   12   13   14   15   16   17   18   19   20
    Bog'liq
    Biologik ketma –ketliklarni ma’lumot bazalari bo’yicha ko’plik

    Protein tuzilishi ma’lumotlar bazalari 
    Protein ma’lumotlar banki (PDB), quyidagilarni o‘z ichiga oladi: 

    Evropada protein ma’lumotlar banki (PDBe) 

    Yaponiyadagi ProteinDatabank (PDBj 

    Strukturaviy bioinformatika bo‘yicha tadqiqot hamkorligi (RCSB) 

    Proteinlarning strukturaviy tasnifi (SCOP) 

    CATH: Protein tuzilishi tasnifi ma’lumotlar bazasi 
    Protein tuzilishi ma’lumotlar bazasini ko‘rish uchun Protein tuzilishi 
    ma’lumotlar bazasiga qarang. 
    Protein modeli ma’lumotlar bazalari 
    ModBase: qiyosiy oqsil tuzilishi modellari ma’lumotlar bazasi (Sali Lab, 
    UCSF) 
    Proteinlarning o‘xshashlik matritsasi (SIMAP): FASTA yordamida 
    hisoblangan oqsil o‘xshashliklari bazasi 
    Shveytsariya modeli: protein strukturasi modellari uchun server va ombor 


    34 
    AAindex: aminokislotalar indekslari, aminokislotalar mutatsion matritsalari va 
    juftlik aloqa potentsiallari ma’lumotlar bazasi 
    Protein-oqsil va boshqa molekulyar o‘zaro ta’sirlar 

    BioGRID: o‘zaro ta’sir ma’lumotlar to‘plamining umumiy ombori (Samuel 
    Lunenfeld tadqiqot instituti) 

    RNK-bog‘lovchi oqsillar bazasi 

    O‘zaro ta’sir qiluvchi oqsillar ma’lumotlar bazasi (Kaliforniya universiteti) 

    IntAct: molekulyar o‘zaro ta’sirlar uchun ochiq manba ma’lumotlar bazasi 
    (EMBL-EBI) 

    String: oqsillar orasidagi o‘zaro ta’sirlarni o‘rganish uchun ochiq manba 
    molekulyar o‘zaro ta’sir ma’lumotlar bazasi 
    Protein ifodasi ma’lumotlar bazalari 
    Inson oqsillari atlasi: hujayralar, to‘qimalar va organlardagi barcha inson 
    oqsillarini xaritalash maqsadi 
    7-rasm. Protein ifodasi ma’lumotlar bazalari 


    35 

    Download 1,9 Mb.
    1   ...   12   13   14   15   16   17   18   19   20




    Download 1,9 Mb.
    Pdf ko'rish

    Bosh sahifa
    Aloqalar

        Bosh sahifa



    Protein tuzilishi ma’lumotlar bazalari

    Download 1,9 Mb.
    Pdf ko'rish