|
Protein tuzilishi ma’lumotlar bazalariBog'liq Biologik ketma –ketliklarni ma’lumot bazalari bo’yicha ko’plikProtein tuzilishi ma’lumotlar bazalari
Protein ma’lumotlar banki (PDB), quyidagilarni o‘z ichiga oladi:
Evropada protein ma’lumotlar banki (PDBe)
Yaponiyadagi ProteinDatabank (PDBj
Strukturaviy bioinformatika bo‘yicha tadqiqot hamkorligi (RCSB)
Proteinlarning strukturaviy tasnifi (SCOP)
CATH: Protein tuzilishi tasnifi ma’lumotlar bazasi
Protein tuzilishi ma’lumotlar bazasini ko‘rish uchun Protein tuzilishi
ma’lumotlar bazasiga qarang.
Protein modeli ma’lumotlar bazalari
ModBase: qiyosiy oqsil tuzilishi modellari ma’lumotlar bazasi (Sali Lab,
UCSF)
Proteinlarning o‘xshashlik matritsasi (SIMAP): FASTA yordamida
hisoblangan oqsil o‘xshashliklari bazasi
Shveytsariya modeli: protein strukturasi modellari uchun server va ombor
34
AAindex: aminokislotalar indekslari, aminokislotalar mutatsion matritsalari va
juftlik aloqa potentsiallari ma’lumotlar bazasi
Protein-oqsil va boshqa molekulyar o‘zaro ta’sirlar
BioGRID: o‘zaro ta’sir ma’lumotlar to‘plamining umumiy ombori (Samuel
Lunenfeld tadqiqot instituti)
RNK-bog‘lovchi oqsillar bazasi
O‘zaro ta’sir qiluvchi oqsillar ma’lumotlar bazasi (Kaliforniya universiteti)
IntAct: molekulyar o‘zaro ta’sirlar uchun ochiq manba ma’lumotlar bazasi
(EMBL-EBI)
String: oqsillar orasidagi o‘zaro ta’sirlarni o‘rganish uchun ochiq manba
molekulyar o‘zaro ta’sir ma’lumotlar bazasi
Protein ifodasi ma’lumotlar bazalari
Inson oqsillari atlasi: hujayralar, to‘qimalar va organlardagi barcha inson
oqsillarini xaritalash maqsadi
7-rasm. Protein ifodasi ma’lumotlar bazalari
|
| |
