Aniq va tabiiy fanlar




Download 1,73 Mb.
bet11/18
Sana17.02.2024
Hajmi1,73 Mb.
#158021
1   ...   7   8   9   10   11   12   13   14   ...   18
Bog'liq
Biologik ketma-ketlikni taqqoslash. Gomologik ketma-ketliklar

Gomologik ketma-ketlikda ko‘plik taqqoslanish uchun dasturlar

Nuklein kislotalar ma’lumotlar bazasi


DNK ma’lumotlar bazalari
Taksonomik fokusli DNK shtrixli ma’lumotlar bazalari uchun #Taksonomik ma’lumotlar bazalariga qarang.
Asosiy ma’lumotlar bazalari Xalqaro nukleotidlar ketma-ketligi ma’lumotlar bazasini (INSD) tashkil qiladi. Bunga quyidagilar kiradi:
Yaponiyaning DNK ma’lumotlar banki (Milliy genetika instituti) EMBL (Yevropa bioinformatika instituti)
GenBank (Milliy biotexnologiya ma’lumotlar markazi)
DDBJ (Yaponiya), GenBank (AQSh) va Yevropa nukleotidlar arxivi (Yevropa) barcha organizmlarning nukleotidlar ketma-ketligi ma’lumotlari uchun ombordir. Uchalasi ham nukleotidlar ketma-ketligi haqidagi ma’lumotlarni qabul qiladi va keyin ular o‘rtasida optimal sinxronizatsiyaga erishish uchun har kuni yangi va yangilangan ma’lumotlarni almashadi. Ushbu uchta ma’lumotlar bazasi birlamchi ma’lumotlar bazalaridir, chunki ular asl ketma-ketlik ma’lumotlarini o‘z ichiga oladi. Ular Sequence Read Archive (SRA) bilan hamkorlik qiladi, u yuqori o‘tkazuvchanlikdagi ketma-ketlik asboblaridan xom o‘qishlarni arxivlaydi.
Biologik ma’lumotlar bazalari biologik ma’lumotlar omboridir.[1] Nuklein kislotalari tadqiqotlari jurnali muntazam ravishda biologik ma’lumotlar bazalari bo‘yicha maxsus sonlarni nashr etadi va bunday ma’lumotlar bazalari ro‘yxatiga ega. 2018-yilgi nashrda 180 ga yaqin shunday maʼlumotlar bazalari roʻyxati va avval tavsiflangan maʼlumotlar bazalariga yangilanishlar kiritilgan.[2] Omics Discovery Index-dan bir nechta biologik ma’lumotlar bazalarini ko‘rib chiqish va qidirish uchun foydalanish mumkin.
Meta ma’lumotlar bazalari - bu yangi ma’lumotlarni yaratish uchun ma’lumotlar to‘g‘risidagi ma’lumotlarni to‘playdigan ma’lumotlar bazalarining ma’lumotlar bazalari. Ular turli manbalardan olingan ma’lumotlarni birlashtirib, uni yangi va qulayroq shaklda yoki ma’lum bir kasallik yoki organizmga e’tibor
qaratgan holda taqdim etish imkoniyatiga ega. ma’lumotlarni qayta ishlash. Metama’lumotlar bazasi so‘zi lug‘atga qo‘shimchadir]. Dastlab, metama’lumotlar faqat teglar, kalit so‘zlar va belgilash sarlavhalari kabi ma’lumotlar haqidagi ma’lumotlarni nazarda tutuvchi oddiy atama edi.

Download 1,73 Mb.
1   ...   7   8   9   10   11   12   13   14   ...   18




Download 1,73 Mb.