• Model organizmlar ma’lumotlar bazasi
  • Ikkilamchi ma’lumotlar bazalari quyidagilardir
  • Boshqa ma’lumotlar bazalari
    		•

    Aniq va tabiiy fanlar




    Download 1,73 Mb.
    bet12/18
    Sana17.02.2024
    Hajmi1,73 Mb.
    #158021
    1   ...   8   9   10   11   12   13   14   15   ...   18
    Bog'liq
    Biologik ketma-ketlikni taqqoslash. Gomologik ketma-ketliklar

    ConsensusPathDB: molekulyar funktsional o‘zaro ta’sir ma’lumotlar bazasi, boshqa 12 ma’lumotni birlashtirgan
    Entrez (Milliy biotexnologiya axborot markazi)
    Neuroscience Information Framework (Kaliforniya universiteti, San-Diego): yuzlab nevrologiyaga tegishli manbalarni birlashtiradi; ko‘plari quyida keltirilgan

    Model organizmlar ma’lumotlar bazasi


    Model organizmlar ma’lumotlar bazalari intensiv o‘rganilayotgan organizmlar uchun chuqur biologik ma’lumotlarni taqdim etadi.
    PomBase: Schizosakcharomyces pombe bo‘linish xamirturushlari uchun ma’lumotlar bazasi.
    SubtiWiki: Bacillus subtilis bakteriyasi uchun integratsiyalangan ma’lumotlar bazasi.

    Ikkilamchi ma’lumotlar bazalari quyidagilardir:


    • 23andMe ma’lumotlar bazasi

    • HapMap

    • OMIM (Insonda onlayn Mendel merosi): irsiy kasalliklar

    • RefSeq

    1000 Genom loyihasi: 2008-yil yanvar oyida boshlangan. Turli etnik guruhlardan bo‘lgan mingdan ortiq anonim ishtirokchilarning genomlari tahlil qilindi va ommaga taqdim etildi.
    EggNOG ma’lumotlar bazasi: 5090 organizm va 2502 virusga asoslangan ierarxik, funktsional va filogenetik izohli orfologiya resursi. U bir nechta ketma- ketlikni moslashtirish va maksimal ehtimollik daraxtlarini, shuningdek, keng funktsional izohlarni taqdim etadi.[5][6]

    Boshqa ma’lumotlar bazalari


    • Nukleosoma joylashuvi mintaqasi ma’lumotlar bazasi

    • Gen ifodasi ma’lumotlar bazalari (asosan mikroarray ma’lumotlari)

    • Genom ma’lumotlar bazalari

    Ushbu ma’lumotlar bazalari genom ketma-ketligini to‘playdi, ularni izohlaydi va tahlil qiladi va jamoatchilikka kirishni ta’minlaydi. Ba’zilar hisoblangan izohlarni yaxshilash uchun eksperimental adabiyotlarni qo‘shishadi. Ushbu ma’lumotlar bazalarida ko‘plab turlar genomlari yoki bitta model organizm genomlari bo‘lishi mumkin.
    ArrayExpress: funktsional genomik ma’lumotlar arxivi; EMBL dan yuqori samarali funktsional genomik tajribalar ma’lumotlarini saqlaydi
    Bioinformatika kombayn

    Download 1,73 Mb.
    1   ...   8   9   10   11   12   13   14   15   ...   18




    Download 1,73 Mb.