|
MobiDB: ichki protein buzilishi annotatsiyasining ma’lumotlar bazasi (Padua universiteti)
neXtProt
|
| bet | 15/18 | | Sana | 17.02.2024 | | Hajmi | 1,73 Mb. | | #158021 |
Bog'liq Biologik ketma-ketlikni taqqoslash. Gomologik ketma-ketliklarMobiDB: ichki protein buzilishi annotatsiyasining ma’lumotlar bazasi (Padua universiteti)
neXtProt: inson oqsiliga asoslangan bilim manbai
Pfam: oqsillar oilalari moslashuvlar va HMMlar ma’lumotlar bazasi (Sanger instituti)
PRINTS: oqsil barmoq izlari to‘plami (Manchester universiteti)
PROSITE: protein oilalari va domenlari ma’lumotlar bazasi
Protein axborot resursi (Jorjtaun universiteti tibbiyot markazi [GUMC]) SUPERFAMILY: superfamilalarni ifodalovchi HMM kutubxonasi va barcha to‘liq ketma-ket organizmlar uchun (super oila va oila) izohlari ma’lumotlar bazasi
Swiss-Prot: oqsil ma’lumotlar bazasi (Shveytsariya bioinformatika instituti)
NCBI: oqsil ketma-ketligi va ma’lumotlar bazasi (Milliy biotexnologiya ma’lumotlar markazi)
Protein tuzilishi ma’lumotlar bazalari
Protein ma’lumotlar banki (PDB), quyidagilarni o‘z ichiga oladi:
Evropada protein ma’lumotlar banki (PDBe)
Yaponiyadagi ProteinDatabank (PDBj
Strukturaviy bioinformatika bo‘yicha tadqiqot hamkorligi (RCSB)
Proteinlarning strukturaviy tasnifi (SCOP)
CATH: Protein tuzilishi tasnifi ma’lumotlar bazasi
Protein tuzilishi ma’lumotlar bazasini ko‘rish uchun Protein tuzilishi ma’lumotlar bazasiga qarang.
Protein modeli ma’lumotlar bazalari
ModBase: qiyosiy oqsil tuzilishi modellari ma’lumotlar bazasi (Sali Lab, UCSF)
Proteinlarning o‘xshashlik matritsasi (SIMAP): FASTA yordamida hisoblangan oqsil o‘xshashliklari bazasi
Shveytsariya modeli: protein strukturasi modellari uchun server va ombor
AAindex: aminokislotalar indekslari, aminokislotalar mutatsion matritsalari va juftlik aloqa potentsiallari ma’lumotlar bazasi
Protein-oqsil va boshqa molekulyar o‘zaro ta’sirlar
BioGRID: o‘zaro ta’sir ma’lumotlar to‘plamining umumiy ombori (Samuel Lunenfeld tadqiqot instituti)
|
| |
