|
Aminokislota tarkibini aniqlashBog'liq Oqsillardagi barqarorlik va aylanish (Folding)(20) caeAminokislota tarkibini aniqlash
Odatda buyurtma qilingan ketma-ketlikni topishga urinishdan oldin
oqsilning tartibsiz aminokislota tarkibini bilish maqsadga muvofiqdir, chunki
bu bilimlar ketma-ketlikdagi xatolarni aniqlashni osonlashtirish yoki noaniq
natijalarni farqlash uchun ishlatilishi mumkin. Ayrim aminokislotalarning
chastotasi haqidagi bilimlardan qaysi birini tanlash uchun foydalanish
mumkin proteaz oqsilni hazm qilish uchun ishlatish. Past darajadagi nostandart
aminokislotalarning (masalan, norleusin) oqsillarga noto'g'ri qo'shilishi ham
aniqlanishi
mumkin.
[1]
Odatda
deb
ataladigan
umumlashtirilgan
usul aminokislotalar tahlili
[2]
aminokislotalar chastotasini aniqlash uchun
quyidagilar:
1.
Ma'lum miqdordagi oqsilni tarkibiga kiruvchi aminokislotalarga
gidroliz qiling.
2.
Aminokislotalarni qandaydir tarzda ajratib oling va miqdorini
aniqlang.
Gidroliz
Gidroliz oqsil
namunasini
6
M
da
qizdirish
orqali
amalga
oshiriladi xlorid kislota 24 soat yoki undan ko'proq vaqt davomida 100-110 °
S gacha. Ko'p miqdordagi oqsillar hidrofob guruhlar uzoqroq isitish davrlarini
talab qilishi mumkin. Ammo, bu holatlar shunchalik kuchliki, ba'zi
aminokislotalar
(serin, treonin, tirozin, triptofan, glutaminva sistein)
tanazzulga uchragan. Biokimyo Onlayn ushbu muammoni chetlab o'tish uchun
har xil vaqt uchun alohida namunalarni isitishni, har bir olingan eritmani tahlil
qilishni va gidrolizning nolga teng vaqtiga ekstrapolyatsiyani taklif qiladi.
Rastall degradatsiyani oldini olish yoki kamaytirish uchun turli xil reagentlarni
taklif qiladi, masalan tiol reaktivlar yoki fenol triptofan va tirozinni xlor va
oksidlanishdan oldin sistein ta'siridan himoya qilish. U shuningdek miqdorini
o'lchashni taklif qiladi ammiak darajasini aniqlash uchun rivojlandi amid
gidrolizi.
|
| |