SSCP (single strand conformation polymorphism)
- PCR ile 200-800 bp’lik DNA dizisi çoğaltılır.
- PCR ürünü formamid yükleme tamponu ile karıştırılıp 95C’de 5 dk denatüre edildikten hemen sonra buz üzerine alınarak soğutulur.
- Denatüre haldeki PCR ürünleri vakit kaybetmeden poliakrilamid non-denatüre jele yüklenir.
- Tek zincirli ürünler elektroforez ile birbirinden ayrılır.
- Tek zincirli DNA’nın elektroforezdeki hareketi yapısal konformasyonuna bağlıdır. Tek bazlık fark bile konformasyonunu değiştirir ve elektroforezdeki hareketinde farklılık yaratır.
- Elektroforez sonucunda jel gümüş nitrat boyası ile boyanır.
| 