|
Eng oddiy holatda PCRni o'tkazish uchun quyidagi komponentlar talab qilinadi
|
bet | 2/6 | Sana | 17.12.2023 | Hajmi | 0,49 Mb. | | #121581 |
Bog'liq PCREng oddiy holatda PCRni o'tkazish uchun quyidagi komponentlar talab qilinadi: - Eng oddiy holatda PCRni o'tkazish uchun quyidagi komponentlar talab qilinadi:
- DNKning amplifikatsiyaga kerak bo'lgan qismini o'z ichiga olgan DNK-matritsa.
- Istalgan DNK fragmentining turli iplarining qarama-qarshi uchlarini to'ldiruvchi ikkita praymer.
- Termostabil DNK polimeraza- DNKning polimerlanish reaksiyasini katalizlovchi fermentdir. PCRda foydalanish uchun polimeraza uzoq vaqt davomida yuqori haroratlarda faol qolishi kerak, shuning uchun termofillardan ajratilgan fermentlar qo'llaniladi - Thermus aquaticus (Taq polimeraza), Pyrococcus furiosus (Pfu polimeraza), Pyrococcus woesei (Pwo polimeraza) va boshqalar.
- Dezoksiribonukleozid trifosfatlar (dATP, dGTP, dCTP, dTTP).
- Polimeraza ishlashi uchun zarur bo'lgan Mg2+ ionlari.
- Kerakli reaksiya sharoitlarini ta'minlovchi bufer eritma - pH, eritmaning ion kuchi. Tuzlar, sigir zardobi albumini o'z ichiga oladi.
Mavjud namunada kerakli DNK ketma-ketligini aniq aniqlash va ko'paytirish uchun komplementar qisqa (18-30 nukleotid) fragmentlar - primerlarni yaratish uchun uning uchlaridagi nukleotidlar ketma-ketligini bilish kerak. Rasmda ketma-ketlikning ma'lum uchlari ko'k rang bilan belgilangan, qora esa kerakli DNK fragmentidir. - Mavjud namunada kerakli DNK ketma-ketligini aniq aniqlash va ko'paytirish uchun komplementar qisqa (18-30 nukleotid) fragmentlar - primerlarni yaratish uchun uning uchlaridagi nukleotidlar ketma-ketligini bilish kerak. Rasmda ketma-ketlikning ma'lum uchlari ko'k rang bilan belgilangan, qora esa kerakli DNK fragmentidir.
- Ikki zanjirli DNK matritsasini DNK zanjirlarini ajratish uchun 0,5-2 daqiqa davomida 94-96 °C (yoki ayniqsa termostabil polimeraza ishlatilsa 98 °C) gacha qizdiriladi.
- Harorat pasayadi va primerlar birlashadi. Iplar ajralgach, harorat pasaytiriladi, shunda primerlar o'zlarining to'ldiruvchi DNK hududlari bilan bir ipli matriksga bog'lanishi mumkin.Bu bosqich toblanish deb ataladi. Toblanish harorati primerlarning tarkibiga bog'liq va odatda ularning erish haroratidan 4-5 ° C pastroqda tanlanadi. Bosqich vaqti - 0,5-2 daqiqa. Toblanish haroratining noto'g'ri tanlanishi primerlarning matriksga yomon bog'lanishiga (juda yuqori haroratda) yoki noto'g'ri joyda bog'lanishiga va o'ziga xos bo'lmagan mahsulotlarning paydo bo'lishiga (juda past haroratda) olib keladi. PCR ning asosiy elementi DNK namunasi uch xil haroratga ta'sir qiladigan takroriy termal sikldir.
|
| |