Fermentlar tuzilishi.
Fermentlar oqsil tabiatli
bo‘lganligi uchun birlamchi,
ikkilamchi, uchlamchi va
to‘rtlamchi qurilishga egadir.
To‘rt-lamchi qurilishga ega
bo‘lgan fermentlar bir necha
protomerlardan tashkil topgan. Katalitik xususiyatga ega bo‘lgan oddiy
(ferment-proteinlar) va murakkab (ferment-proteidlar) fermentlarga
bo‘linadi. Murakkab fermentlar oqsil qismi (apoferment) va oqsil
bo‘lmagan qismi (kofaktor)dan iborat. Kofaktor bo‘lib metall ionlari
yoki organik birikmalar bo‘lishi mumkin. Apoferment va kofaktor
alohida faol emasdir, ularning birikishi faol fermentni hosil qiladi va
uni xoloferment deyiladi. Kofaktorlar termostabil moddalardir,
ko‘pchilik fermentlar qizitilganda faolligini yo‘qotadi.
36-rasm.
Fermentning faol markazi
35-rasm.
Fermentativ faollik
114
Oddiy va murakkab fermentlarning uchlamchi qurilishida ma’lum
bir funksiyani bajaruvchi maxsus markazlar mavjud.
Murakkab fermentlarning faol markaziga kofaktor kiradi. Oligomer
fermentlarda faol markazlar soni subbirliklar soniga teng, yoki ikkita
subbirliklar faol markazni hosil qilishi mumkin. Ba’zi fermentlarda faol
markazdan tashqari regulyator – allosterik markaz bo‘lishi mumkin.
Bu markaz modifikatorlar bilan birikadi. Modifikatorlar ferment
faolligini oshirishi (effektorlar) yoki susaytirishi (ingibitorlar) bo‘lishi
mumkin.
Faol markazda kontakt – ya’ni substrat bilan birikuvchi, katalitik –
fermentativ reaksiyani katalizlaydigan joy mavjud (36 rasm). Aktiv
markaz polipeptid zanjirlarning turli joylaridan o‘rin olgan 12-16
aminokislota qoldiqlaridan hosil bo‘ladi. Polipeptid zanjirining boshqa
aminokislota qoldiqlari faol markazni to‘g‘ri fazoviy joylashishini va
reaksion holatini belgilaydi. Oddiy fermentlarda faol markazning
kontakt va katalitik joylari aminokislotalarning funksional faol
guruhlaridan hosil bo‘ladi, murakkab fermentlarda asosiy vazifani
kofaktorlar bajaradi.
Fermentativ katalizda quyidagi funksional faol guruhlar ishtirok
etadi: dikarbon aminokislotalarning COOH va peptid zanjirining C –
uchlarining COOH guruhlari; lizinning NH
+
2
guruhi va polipeptid
zanjirining N – uchi NH
3
guruhi; argininnig guanidin; triptofanning
indol; gistidinning imidazol, serin va treoninning OH; oltingugurt
tutuvchi aminokislotalarning SH-guruhlari, tirozinni fenol guruhlari
ishtirok etadi.
Kofaktorlar apoferment bilan birikishiga qarab 2 guruhga bo‘linadi:
Prostetik gruppa – bunda kofaktor apoferment bilan kovalent
bog‘lanadi.
Koferment – bunda kofaktor apoferment bilan nokovalent bog‘lanadi
va tez dissotsiatsiyalanadi (37-rasm).
Kofaktorlar strukturasiga ko‘ra vitaminli va vitamin bo‘lmagan
kofaktorlarga bo‘linadi. Vitaminli koferment tiaminli (TMF, TDF, TTF),
flavinli (FAD, FMN), pantotenatli (KoA, defosfo-KoA, 1-
fosfopantotenat), nikotinamidli (NAD, NADF), piridoksinli (PALF,
PAMF), flavinli (TGFK), kobamidli (metilkobalamin,
dezoksimetilkobalamin), biotinli (karboksibiotin), lipoil (lipoamid),
xinonli (ubixinon, plastoxinon) va karnitinli (karnitin)larga bo‘linadi.
Vitamin bo‘lmagan kofermentlar o‘z navbatida nukleotidli (UDFGK),
fosfomonosaharidli (glyukozo-1,6-difosfat, 2,3-difosfoglitserat),
metalloporfirinli (gemlar, xlorofillar) va peptidliga (glutation) bo‘linadi.
|
