Bioinformatikaning asosiy prinsiplari.
Bioinformatikaning qisqacha tarixi
Bioinformatikaning predmeti?
Bioinformatikaysi fanlar bilan aloqador?
Bioinformatikaning qanday asosiy vazifalari mavjud?
Qo’llaniladigan eng muhim sohalari
Bioinformatika fanining yutuqlari?
2-Mаvzu: Zamonaviy bioinformatsion ma'lumot bazalari .
Reja
Zamonaviy bioinformatsion ma’lumot bazalari
Ma'lumotlar bazasini tasniflash
Oqsil haqidagi ma’lumot bazalari
PDB - oqsillarning fazoviy tuzilishi. Nazorat ostidagi ma'lumotlar bazalari:
Swiss-Prot - oqsillarning aminokislotalar ketma-ketligini o'z ichiga olgan eng yuqori sifatli ma'lumotlar bazasi;
KEGG - metabolizm haqida ma'lumot;
Ma'lumotlar bazasini tasniflash Bir nechta ma'lumotlar bazasi tasnifi mavjud. Zamonaviy banklar va biologiya ma'lumotlar bazalarini quyidagi ma'lumotlarga ko'ra tasniflash mumkin: • bibliografik; • Birlamchi DNK, RNK, oqsillar ketma-ketligi; Molekulalarning fazoviy tuzilishi. • Genomik; • Boshqa tematik. Dunyoda dastlabki to'rt turdagi ma'lumotlar banklarini qo'llab-quvvatlaydigan bir nechta yirik markazlar mavjud va ma'lum mavzular bo'yicha ma'lumotlar bazalarini o'z ichiga olgan ko'plab tashkilotlar mavjud (masalan, ribosomal genlar bo'yicha ma'lumotlar bazasi yoki fermentlarni tasniflash, p53 gen mutatsiyalari yoki Saccharomyces cerevisiae oqsillari va boshqalar.). Ma'lumotlarning tashkil etilishiga qarab ma'lumotlar bazalari arxiv, derivativ va tuzatilgan ma'lumotlar bazalariga bo'linadi. Arxiv ma'lumotlari bazasi:
• GenBank va EMBL - barcha shifrlangan genomlarning asosiy ketma-ketliklari bu erda saqlanadi
| Tuzilish haqidagi ma’lumot bazalari
• PDB - oqsillarning fazoviy tuzilishi. Nazorat ostidagi ma'lumotlar bazalari:
• SCOP - Oqsillarning tarkibiy tasnifi ma'lumotlar bazasi (oqsil tarkibi tavsiflangan);
PATH
| 