• DNK haqidagi ma’lumot bazalari
    		•

    Ketma-ketlikni taqqoslovchi ma’lumot bazalari




    Download 271.56 Kb.
    bet4/50
    Sana24.03.2024
    Hajmi271.56 Kb.
    #176114
    1   2   3   4   5   6   7   8   9   ...   50
    Bog'liq
    1-Mavzu. Kirish-www.fayllar.org
    Kurs ishi. Toshpo\'lato\'va M, Qarshi davlat universiteti tabiiy fanlar fakulteti zoologiya va -fayllar.org, I bob. Bioinformatika (1)
    Ketma-ketlikni taqqoslovchi ma’lumot bazalari


    1. Oqsil haqidagi ma’lumot bazalari

    • PDB - oqsillarning fazoviy tuzilishi. Nazorat ostidagi ma'lumotlar bazalari:


    • Swiss-Prot - oqsillarning aminokislotalar ketma-ketligini o'z ichiga olgan eng yuqori sifatli ma'lumotlar bazasi;
    • KEGG - metabolizm haqida ma'lumot;
    • FlyBase - Drosophila haqida ma'lumot;
    COG - har birining nomiga qarama-qarshi bo'lgan alifbo ro'yxatidagi ortologik genlar to'g'risidagi ma'lumotlar.
    NCBI Genom ma'lumotlar bazasidagi tirik organizmlarning genomlari ro'yxati Tuzilgan ma'lumotlar bazalari
    Bunday ma'lumotlar bazalari arxivlangan va tuzatilgan ma'lumotlar bazasidan ma'lumotlarni qayta ishlash natijasida olingan:
    • SCOP - Oqsillarning tarkibiy tasnifi ma'lumotlar bazasi (oqsil tarkibi tavsiflangan);
    • PFAM - oqsil oilalari to'g'risidagi ma'lumotlar bazasi;
    • GO (Gen Ontologiyasi) - Genlarni tasniflash (bitta genga boshqacha nom berilmasligi va turli xil genlarga bir xil nom berilmasligi uchun atamalar to'plamini tuzish, terminologiyani tashkil qilish);
    • ProDom - oqsil domenlari. Genomlar va kasalliklar to'g'risidagi ma'lumotlarni o'z ichiga olgan ma'lumotlar bazalarining qiyosiy tavsiflari Biotibbiy ma'lumotlar bazasining maqbul tuzilishi bir nechta funktsional talablarga javob berishi kerak: - ma'lumotlar bazasi hajmi deyarli cheklanmagan bo'lishi kerak (ya'ni, faqat apparat parametrlari bilan cheklangan). Bugungi kunda adabiyotlarda e'lon qilingan ma'lumotlarning ahamiyatsiz qismi ma'lumotlarni rasmiylashtirish bilan bog'liq qiyinchiliklar tufayli ma'lumotlar bazalariga kiritilgan.


    1. DNK haqidagi ma’lumot bazalari

    1. GenBank (NCBI)


    2. EMBL (EBI)


    3. DDJB-Yaponiya




    Nazorat savollari:

    1. Zamonaviy ma’lumot bazalari nima?


    2. Oqsil to’g’risidagi ma’lumot bazalariga misol keltiring


    3. Oqsillar oilalari to’g’risidagi ma’lumot bazasi qaysi?


    4. DNK to’g’risidagi ma’lumot bazalariga misol keltiring


    5. KEGG qanday ma’lumot bazasi?





    Download 271.56 Kb.
    1   2   3   4   5   6   7   8   9   ...   50




    Download 271.56 Kb.
    Bosh sahifa
    Aloqalar
        Bosh sahifa
    Dərs
    Mühazirə
    Qaydalar
    Referat
    Xülasə
    Yazı


    Ketma-ketlikni taqqoslovchi ma’lumot bazalari

    Download 271.56 Kb.