Gambar 113
Jumlah garis kontur yang ditampilkan akan beragam terhadap Starting Value dan Increment yang digunakan; tampilan Anda mungkin agak berbeda dari Gambar 113.
Untuk mengubahnya menjadi kontur isosurface trimatra, buka kembali kotak dialog Plot Molecular Properties Options, lalu pilihlah gambaran 3D Isosurface sebagai pengganti 2D Contours. Kemudian klik-kiri ‘tab’ Isosurface Rendering; pada lembar sifat Isosurface Rendering, masukkan peubah-peubah seperti pada Gambar 114.
Gambar 114
-
Nilai 0.1 untuk Electrostatic potential contour value berarti permukaan menunjukkan posisi dalam ruang trimatra yang memiliki potensial elektrostatik sebesar 0,1e/ao.
-
Dengan memilih ‘Shaded surface’ sebagai Rendering, digambarkan permukaan yang berbayangan dan padat, serta dibagi menjadi segmen-segmen kecil untuk pewarnaan sehingga memberi tampilan trimatra yang cukup baik pada kecepatan sedang.
Setelah itu, klik-kiri ‘tab’ Isosurface Grid untuk membuka lembar sifat Isosurface Grid (Gambar 115).
Gambar 115
Lembar ini memungkinkan Anda memilih apakah permukaan sebaiknya digambarkan dengan sedikit titik (untuk gambar kasar yang digambarkan dengan cepat) atau banyak titik (untuk gambar halus yang memerlukan waktu lebih lama untuk menggambarnya). Pilihlah grid dengan ukuran mesh Medium, lalu klik-kiri Close untuk memulai perhitungan. Setelah beberapa saat, diperoleh isosurface potensial elektrostatik seperti pada Gambar 116.
Gambar 116
Untuk mengubahnya menjadi kontur isosurface terpetakan trimatra, buka kembali kotak dialog Plot Molecular Properties Options, lalu pilihlah 3D Mapped Isosurface sebagai pengganti 3D Isosurface. Dengan gambaran ini, akan ditampilkan permukaan trimatra yang digambarkan dengan suatu nilai yang ditentukan oleh Total Charge Density (lihat subbab berikut), tetapi diwarnai menurut nilai potensial elektrostatik.
Selanjutnya, bukalah kembali lembar sifat Isosurface Rendering:
-
Pada kotak teks Electrostatic potential contour value isikan 0.1, maka permukaan menun-jukkan posisi dalam ruang trimatra yang memiliki rapatan muatan total sebesar 0,1e/ao3.
-
Pilihlah ‘Gouraud shaded surface’ sebagai Rendering untuk menggambarkan permukaan berbayangan dan halus. Permukaan yang tak tembus-cahaya ini memberikan penampilan trimatra yang optimal, tetapi perlu waktu lama untuk menghitung dan menampilkannya.
Sesudah itu, klik-kiri ‘tab’ Mapped Function Options; pada lembar sifat Mapped Function Options, masukkan peubah-peubah seperti pada Gambar 117.
Gambar 117
-
Dengan nilai minimum sebesar –1.0 dan nilai maksimum sebesar 1.0, permukaan akan diwarnai berdasarkan potensial elektrostatik, mulai dari satu warna untuk nilai 1,0e/ao sampai satu warna lainnya untuk nilai –1,0e/ao.
-
Pengaktifan pilihan Display range legend berarti akan digambarkan suatu legenda yang menunjukkan bagaimana warna-warna permukaan menunjukkan nilai-nilai yang berbeda.
Klik-kiri OK, dan setelah beberapa saat, diperoleh isosurface-terpetakan potensial elektro-statik seperti pada Gambar 118.
Gambar 118
|
