Gambar 107 Menghitung Muatan Atomik (Fungsi Gelombang)

Mula-mula, klik-kiri Display-Labels-Charge-OK untuk memberi label muatan atom pada molekul air. Akan diperoleh muatan 0.00 untuk semua atom yang menunjukkan bahwa belum ada muatan yang diset untuk molekul itu. Untuk menghitung muatan atomik tersebut, klik-kiri Setup-Semi-empirical, lalu pada kotak dialog Semi-empirical Method (Gambar 108), pilihlah metode CNDO.

Klik-kiri Options, maka muncul kotak dialog Semi-empirical Options, lalu masukkan peubah-peubah seperti pada Gambar 109.

1. 
   Muatan total ialah 0, karena air merupakan molekul netral. Kation memiliki muatan total positif, sedangkan muatan total anion negatif.
   
2. 
   Nilai multiplisitas spin total (2S+1; S = spin elektron total dari sistem) ialah 1 (singlet) yang mengasumsikan bahwa air merupakan sistem tertutup. Suatu sistem terbuka dapat memiliki multiplisitas 2, 3, 4 (doblet, triplet, kuartet), atau lebih tinggi.
   
3. 
   Untuk menghitung interaksi spin, digunakan perhitungan SCF dengan metode Restricted Hartree-Fock (RHF), yang mensyaratkan bahwa sepasang spin elektron menempati orbital ruang (spatial orbital) yang sama, dan bahwa sebuah orbital dapat ditempati oleh elektron tunggal. Jika digunakan metode Unrestricted Hartree-Fock (UHF), setiap jenis spin elektron akan ditempatkan pada orbital-orbital ruang yang terpisah (α dan β).
   
4. 
   Perhitungan diset dengan limit konvergensi (konvergensi = keadaan menuju satu titik temu) 0,0001 dan limit ulangan (iterasi) 50. Ini berarti perhitungan berakhir apabila sebelum ulangan ke-50, perbedaan energi setelah dua ulangan berurutan kurang dari 0,0001 kkal mol^-1, atau jika telah dilakukan 50 ulangan, sekalipun perbedaan energi masih lebih dari 0,0001 kkal mol^-1. Apabila saat limit ulangan tercapai, perhitungan masih jauh dari konvergensi, atau jika energi sistem berosilasi, hasilnya dapat menjadi tidak tepat. Semakin kecil limit konvergensi dan semakin besar limit ulangan, fungsi gelombang yang diperoleh akan semakin ajek. Nilai patokan mereka berturut-turut 0,01 kkal mol^-1 dan 50, sedangkan kisaran praktisnya berturut-turut 1–10^-3 dan 50–200. Nilai limit konvergensi yang kecil dan limit ulangan yang besar diperlukan saat mencari keadaan peralihan.
   
5. 
   Perhitungan dilakukan pada keadaan elektronik terendah (Lowest) dari multiplisitas spin yang digunakan, tanpa akselerasi konvergensi khusus. Keadaan yang terendah berikutnya (Next Lowest) ialah keadaan tereksitasi secara elektronik yang pertama.