Cambridge Structural Database (CSD) Nucleic Acid Database (NDB) Brookhaven Protein DataBank (PDB) www.chemweb.com www.sciencedirect.com http://www.freechemical.info/freeSoftware/kinds.php КИМЁДА КЎЛЛАНИЛАДИГАН ПРОГРАММАЛАР - Ёрдамчи программалар: ChemWin, IsisDraw, ChemOffice, Facio, MaSK, Avagadro, WinMostar, GaussView, ChemCraft ва б.
- Хисоблаш программалари: Gaussian, Gamess, Firefly (PC Gamess), ADF, Spartan, Hyperchem, Mopac2012, ChemOffice ва б.
- Структуралар асосида мавжуд бўлиши мумкин бўлган биологик фаолликлар хақида хулосалар. PASS (Prediction Activity Spectra for Substances)
- QSAR/QSPR усулларида ишлатиладиган мажмуалар Dragon, BuildQsar
- Молекуляр докинг (Molecular Docking) программалари: AutoDock, Dock, DOT, DockVision FRED, FlexiDock, GRAMM, ICM-Dock ва б.
ХИСОБЛАШ УСУЛЛАРИ
1. Эмпирик усуллар.
Молекуляр механика MMX, MMП2,
AMBER, BIO+(CHARM), OPLS
2. Ярим эмпирик усуллар.
CNDO, INDO, MINDO/3, MNDO, AM1, PM3,
PM5, RM1, PM6 ва PM7
3. Ноэмпирик (ab initio) усуллар.
STO-3G, 3-21G, 4-21G, …, 6-31G, 6-31G*,
6-31G**
Хисоблаш программалари:
Gaussian, Gamess, Firefly (PC Gamess), ADF, Spartan, Hyperchem,
Mopac2012, ChemOffice ва б.
Хисоблаш усулларидан олинадиган характеристикалар Геометрия: боғ узунликлари, валент ва торсион бурчаклари, конформацион холатлар, таутомер холатлар ва б. Энергетик характеристикалар: Хосил бўлиш иссиклиги қийматлари (теплота образования), умумий энергия, орбиталлар энергиялари ва б. Спектрал муаммолар ечимлари: УБ-, ИҚ-, Раман спектрлари хисоблари Заряд тақсимотлари ва б. АННОТАЦИЯЛАР ОЛИШ АННОТАЦИЯЛАР ОЛИШ www.chemweb.com www.sciencedirect.com РЖхим – Реферативный журнал по химии Автор кўрсаткичи (Авторский указатель) Эркин том (Свободный том, А-Я) 1Б-26Б Chemical Abstracts
Ёрдамчи программалар:
ChemWin, IsisDraw, ChemOffice, Facio, MaSK, Avagadro, WinMostar, GaussView, ChemCraft ва б.
Геометрияларни чизиш, хисоблаш учун тайёр холатга келтириш
Бошланғич ва охирги геометрия
|
