20
1.3. DNK / RNK sekanslaridan bashorat qilish.
Biologiyada oqsillar tomonidan ishlab chiqariladi tarjima mRNK
tarkibidagi
kodonlar ketma-ketligidan kelib chiqqan oqsillar ketma-ketligi bilan xabarchi
RNK (mRNA). MRNK ning o'zi hosil bo'ladi transkripsiya va genlarni
o'zgartirishi mumkin. Ushbu jarayonlar DNK ketma-ketliklaridan
oqsillar
ketma-ketligini bashorat qilishni avtomatlashtirish uchun kompyuter
algoritmlaridan foydalanish uchun etarli darajada tushunilgan, masalan, butun
genomli DNK-sekvensiyalash loyihalari kabi va
oqsillar ketma-ketligining
katta ma'lumotlar bazalarini yaratishga olib keldi. UniProt. Prognoz qilingan
oqsillar ketma-ketligi massa spektrometriyasi orqali oqsillarni aniqlash uchun
muhim manba hisoblanadi.
Tarixiy
jihatdan, Edman degradatsiyasi bilan aniqlangan qisqa oqsillar
ketma-ketligi (10-15 qoldiq) DNK ketma-ketligiga tarjima qilingan, ular zond
yoki primer sifatida izolyatsiya qilish
uchun ishlatilishi mumkin
edi. molekulyar klonlar tegishli gen yoki qo'shimcha DNKning. Keyin
klonlangan DNKning ketma-ketligi aniqlandi va oqsilning to'liq aminokislota
ketma-ketligini aniqlash uchun foydalanildi.
Bioinformatika vositalari
Bioinformatika ommaviy spektrlarni talqin
qilishga yordam beradigan
vositalar mavjud (qarang) Peptidlarning ketma-ketligi), oqsillar ketma-
ketligini taqqoslash yoki tahlil qilish uchun (qarang Tartibni tahlil qilish), yoki
peptid yoki oqsil ketma-ketliklari yordamida ma'lumotlar
bazalarini qidirish
(qarang Portlash).
